Doraemon, Nobita dan teman-temannya kembali berpetualang di tahun 2018 ini dengan tema bajak laut. Tak bisa dipungkiri lagi, jika tujuan utama para bajak laut adalah pulau harta karun, yaitu di pulau Karibia. Doraemon, Nobita, Giant, Suneo dan Shizuka berlayar dalam satu kapal bajak laut milik doraemon yang dinahkodai oleh kapten Nobita. Meskipun terjadi keributan ketika memilih siapa kaptennya dan yang pasti tokoh utamalah yang akan menjadi kaptennya. Walaupun sebenarnya Nobita tidak ingin menjadi kapten karena harus mendapatkan tugas yang sangat berat, yaitu menjaga kapal beserta awaknya agar tetap selamat sampai tujuan. Pada saat diperjalanan menuju pulau karibia, Shizuka sempat diculik oleh beberapa perompak, dan akhirnya terpaksa seluruh teman-temannya mencari Shizuka terlebih dahulu sebelum ke pulau Karibia. Setelah Shizuka kembali dengan selamat mereka melanjutkan perjalanannya ke pulau Karibia, ombak menghantam kapal mereka, angin menerpa layar mereka sampai mau rubuh. Tapi semua itu bisa mereka lewati dengan bantuan mini-dora dari alat ajaibnya doraemon. Sampai suatu ketika mereka terdampar di sebuah pulau misterius yang bernama Pulau Harta Misterius.